Tandis que les humains et les Ildirans ont failli être exterminés par les Shana Rei et leurs alliés robots, ils cherchent comment combattre le nuage noir d'antimatière de ces entités. Persuadés d'avoir trouvé le moyen de stopper leurs ennemis, les scientifiques de la Confédération testent une nouvelle arme. Mais leur échec cuisant risque de précipiter la perte de l'humanité.