Marie Balmary a publié de nombreux ouvrages parmi lesquels, chez Grasset et au Livre de Poche Biblio Essais, L'Homme aux statues : Freud et la faute cachée du père (1979, 1994) ; Le Sacrifice interdit (1986) ; La Divine Origine (1993) et, aux éditions Albin Michel, Le Moine et la Psychanalyste (2005).