Journaliste pendant une trentaine d'années, Eric Hoesli a travaillé pour la plupart des titres de la presse écrite suisse romande. Il a été rédacteur en chef de L'Hebdo en 1996, a fondé le quotidien Le Temps en 1997, avant de devenir son premier rédacteur en chef et directeur.
De 2005 à 2014, il a été directeur éditorial du groupe Edipresse puis de Tamedia et responsable des journaux romands 24 Heures, La Tribune de Genève, Le Matin, Le Matin Dimanche.
En 2014, il est nommé professeur à l'École polytechnique fédérale de Lausanne (EPFL) et professeur invité au Global Studies Institute (GSI) de l'université de Genève. Il dirige un programme commun aux deux institutions, consacré au monde russe, qui tend à développer les compétences multiculturelles des étudiants du point de vue anthropologique, économique, politique ou linguistique. Il a publié aux éditions des Syrtes, en 2006, À la conquête du Caucase. Épopée géopolitique et guerres d'influence, unanimement salué par la critique.