Alain Ibagnez a exercé son métier de médecin dans deux MAS et un FAM. Il enseigne au DIU déficience intellectuelle/handicap mental de l'université Claude Bernard Lyon 1. Il a participé, à la demande de l'ANESM (Agence nationale de l'évaluation et de la qualité des établissements et services sociaux et médico-sociaux), à la rédaction des recommandations sur les « Besoins en santé des personnes handicapées ».